Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPTFQ12830 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms