Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAGPQ0VAQ4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAGPQ0VAQ4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms