Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms