Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBQ06643 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBQ06643 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBQ06643 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBQ06643 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBQ06643 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBQ06643 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBQ06643 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBQ06643 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBQ06643 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBQ06643 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBQ06643 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBQ06643 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBQ06643 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBQ06643 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBQ06643 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBQ06643 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBQ06643 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBQ06643 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBQ06643 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBQ06643 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBQ06643 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBQ06643 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBQ06643 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBQ06643 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBQ06643 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBQ06643 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBQ06643 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBQ06643 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBQ06643 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBQ06643 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBQ06643 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBQ06643 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBQ06643 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBQ06643 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBQ06643 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBQ06643 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBQ06643 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBQ06643 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBQ06643 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBQ06643 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBQ06643 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBQ06643 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBQ06643 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBQ06643 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBQ06643 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBQ06643 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBQ06643 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBQ06643 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBQ06643 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBQ06643 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBQ06643 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBQ06643 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBQ06643 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBQ06643 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBQ06643 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBQ06643 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBQ06643 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBQ06643 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBQ06643 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBQ06643 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBQ06643 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBQ06643 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBQ06643 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBQ06643 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBQ06643 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBQ06643 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBQ06643 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBQ06643 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBQ06643 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBQ06643 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBQ06643 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms