Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDPQ00604 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDPQ00604 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDPQ00604 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDPQ00604 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDPQ00604 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDPQ00604 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDPQ00604 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDPQ00604 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDPQ00604 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDPQ00604 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDPQ00604 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDPQ00604 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDPQ00604 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NDPQ00604 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDPQ00604 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDPQ00604 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NDPQ00604 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDPQ00604 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDPQ00604 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDPQ00604 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDPQ00604 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDPQ00604 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDPQ00604 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDPQ00604 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDPQ00604 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDPQ00604 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDPQ00604 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDPQ00604 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDPQ00604 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDPQ00604 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDPQ00604 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDPQ00604 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDPQ00604 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDPQ00604 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDPQ00604 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDPQ00604 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDPQ00604 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDPQ00604 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDPQ00604 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDPQ00604 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDPQ00604 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDPQ00604 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDPQ00604 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDPQ00604 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDPQ00604 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDPQ00604 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDPQ00604 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDPQ00604 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDPQ00604 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDPQ00604 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDPQ00604 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDPQ00604 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDPQ00604 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDPQ00604 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDPQ00604 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDPQ00604 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NDPQ00604 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDPQ00604 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NDPQ00604 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NDPQ00604 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDPQ00604 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDPQ00604 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDPQ00604 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDPQ00604 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDPQ00604 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDPQ00604 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDPQ00604 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDPQ00604 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDPQ00604 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NDPQ00604 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDPQ00604 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDPQ00604 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDPQ00604 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDPQ00604 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDPQ00604 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDPQ00604 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDPQ00604 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDPQ00604 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NDPQ00604 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDPQ00604 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDPQ00604 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDPQ00604 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NDPQ00604 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms