Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL23AP62750 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms