Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE2HP62256 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2HP62256 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms