Protein–RNA interactions for Protein: P61236

YPEL3, Protein yippee-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL3P61236 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
YPEL3P61236 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
YPEL3P61236 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms