Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX2P48431 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX2P48431 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX2P48431 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX2P48431 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX2P48431 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX2P48431 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX2P48431 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX2P48431 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX2P48431 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX2P48431 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SOX2P48431 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SOX2P48431 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX2P48431 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX2P48431 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX2P48431 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX2P48431 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX2P48431 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SOX2P48431 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SOX2P48431 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX2P48431 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX2P48431 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX2P48431 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX2P48431 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX2P48431 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SOX2P48431 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SOX2P48431 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX2P48431 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX2P48431 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX2P48431 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX2P48431 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SOX2P48431 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX2P48431 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX2P48431 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX2P48431 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX2P48431 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX2P48431 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX2P48431 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX2P48431 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX2P48431 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX2P48431 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX2P48431 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX2P48431 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX2P48431 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX2P48431 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SOX2P48431 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX2P48431 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX2P48431 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX2P48431 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX2P48431 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX2P48431 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX2P48431 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX2P48431 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX2P48431 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX2P48431 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX2P48431 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX2P48431 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOX2P48431 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SOX2P48431 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms