Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHAP40939 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHAP40939 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHAP40939 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHAP40939 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HADHAP40939 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HADHAP40939 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HADHAP40939 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHAP40939 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHAP40939 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHAP40939 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHAP40939 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHAP40939 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHAP40939 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHAP40939 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHAP40939 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHAP40939 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHAP40939 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHAP40939 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HADHAP40939 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HADHAP40939 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HADHAP40939 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HADHAP40939 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HADHAP40939 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HADHAP40939 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HADHAP40939 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HADHAP40939 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HADHAP40939 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HADHAP40939 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HADHAP40939 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HADHAP40939 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHAP40939 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHAP40939 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHAP40939 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHAP40939 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHAP40939 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHAP40939 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHAP40939 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHAP40939 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHAP40939 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HADHAP40939 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHAP40939 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHAP40939 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHAP40939 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHAP40939 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHAP40939 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHAP40939 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHAP40939 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHAP40939 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHAP40939 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HADHAP40939 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHAP40939 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHAP40939 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHAP40939 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHAP40939 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HADHAP40939 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHAP40939 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHAP40939 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHAP40939 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHAP40939 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHAP40939 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHAP40939 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHAP40939 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHAP40939 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHAP40939 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHAP40939 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHAP40939 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HADHAP40939 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHAP40939 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHAP40939 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHAP40939 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHAP40939 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHAP40939 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHAP40939 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HADHAP40939 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHAP40939 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHAP40939 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHAP40939 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHAP40939 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHAP40939 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHAP40939 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HADHAP40939 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HADHAP40939 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HADHAP40939 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HADHAP40939 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HADHAP40939 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HADHAP40939 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HADHAP40939 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HADHAP40939 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HADHAP40939 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHAP40939 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHAP40939 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHAP40939 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHAP40939 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHAP40939 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHAP40939 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHAP40939 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHAP40939 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHAP40939 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHAP40939 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.5 ms