Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX11P35716 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX11P35716 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX11P35716 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX11P35716 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX11P35716 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX11P35716 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX11P35716 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX11P35716 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX11P35716 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX11P35716 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX11P35716 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX11P35716 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX11P35716 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX11P35716 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX11P35716 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX11P35716 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX11P35716 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX11P35716 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX11P35716 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX11P35716 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX11P35716 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX11P35716 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX11P35716 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX11P35716 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX11P35716 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX11P35716 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX11P35716 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX11P35716 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX11P35716 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX11P35716 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX11P35716 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX11P35716 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX11P35716 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX11P35716 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX11P35716 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX11P35716 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX11P35716 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX11P35716 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX11P35716 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX11P35716 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX11P35716 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX11P35716 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX11P35716 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX11P35716 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX11P35716 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX11P35716 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX11P35716 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX11P35716 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX11P35716 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX11P35716 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX11P35716 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX11P35716 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX11P35716 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX11P35716 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX11P35716 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX11P35716 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX11P35716 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX11P35716 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX11P35716 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX11P35716 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX11P35716 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX11P35716 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX11P35716 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX11P35716 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX11P35716 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX11P35716 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX11P35716 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX11P35716 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX11P35716 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX11P35716 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms