Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HRCP23327 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
HRCP23327 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HRCP23327 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HRCP23327 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
HRCP23327 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HRCP23327 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HRCP23327 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
HRCP23327 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
HRCP23327 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
HRCP23327 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
HRCP23327 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
HRCP23327 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
HRCP23327 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
HRCP23327 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
HRCP23327 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HRCP23327 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HRCP23327 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HRCP23327 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HRCP23327 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HRCP23327 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HRCP23327 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HRCP23327 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HRCP23327 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HRCP23327 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HRCP23327 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HRCP23327 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
HRCP23327 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
HRCP23327 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HRCP23327 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
HRCP23327 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
HRCP23327 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
HRCP23327 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
HRCP23327 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
HRCP23327 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
HRCP23327 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
HRCP23327 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
HRCP23327 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
HRCP23327 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
HRCP23327 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
HRCP23327 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
HRCP23327 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
HRCP23327 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
HRCP23327 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
HRCP23327 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
HRCP23327 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
HRCP23327 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
HRCP23327 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
HRCP23327 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
HRCP23327 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
HRCP23327 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
HRCP23327 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
HRCP23327 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
HRCP23327 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HRCP23327 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HRCP23327 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HRCP23327 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HRCP23327 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HRCP23327 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HRCP23327 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
HRCP23327 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
HRCP23327 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
HRCP23327 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
HRCP23327 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
HRCP23327 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
HRCP23327 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
HRCP23327 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
HRCP23327 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
HRCP23327 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
HRCP23327 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
HRCP23327 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
HRCP23327 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
HRCP23327 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
HRCP23327 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
HRCP23327 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
HRCP23327 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
HRCP23327 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
HRCP23327 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
HRCP23327 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
HRCP23327 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
HRCP23327 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
HRCP23327 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HRCP23327 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HRCP23327 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HRCP23327 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HRCP23327 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HRCP23327 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HRCP23327 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HRCP23327 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
HRCP23327 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HRCP23327 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
HRCP23327 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
HRCP23327 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
HRCP23327 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HRCP23327 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
HRCP23327 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HRCP23327 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HRCP23327 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
HRCP23327 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HRCP23327 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms