Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms