Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPIND1P05546 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPIND1P05546 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPIND1P05546 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPIND1P05546 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPIND1P05546 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SERPIND1P05546 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPIND1P05546 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms