Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRP01130 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRP01130 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRP01130 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRP01130 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRP01130 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRP01130 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRP01130 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRP01130 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRP01130 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRP01130 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRP01130 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRP01130 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRP01130 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRP01130 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRP01130 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LDLRP01130 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LDLRP01130 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRP01130 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRP01130 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRP01130 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRP01130 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRP01130 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRP01130 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRP01130 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRP01130 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRP01130 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRP01130 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRP01130 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRP01130 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRP01130 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRP01130 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRP01130 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRP01130 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRP01130 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRP01130 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRP01130 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRP01130 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRP01130 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRP01130 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRP01130 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRP01130 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRP01130 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRP01130 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRP01130 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRP01130 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRP01130 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRP01130 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRP01130 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRP01130 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRP01130 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRP01130 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRP01130 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRP01130 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRP01130 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRP01130 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRP01130 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRP01130 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRP01130 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRP01130 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRP01130 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRP01130 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRP01130 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRP01130 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRP01130 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRP01130 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRP01130 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRP01130 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRP01130 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRP01130 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRP01130 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRP01130 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRP01130 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRP01130 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRP01130 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRP01130 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRP01130 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRP01130 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LDLRP01130 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LDLRP01130 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRP01130 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRP01130 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRP01130 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRP01130 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRP01130 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRP01130 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRP01130 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRP01130 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRP01130 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRP01130 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRP01130 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRP01130 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRP01130 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRP01130 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRP01130 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRP01130 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRP01130 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRP01130 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRP01130 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRP01130 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms