Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRPM2O94759 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TRPM2O94759 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRPM2O94759 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms