Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP12O75317 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP12O75317 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP12O75317 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP12O75317 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP12O75317 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP12O75317 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP12O75317 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP12O75317 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP12O75317 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP12O75317 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP12O75317 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP12O75317 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP12O75317 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP12O75317 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP12O75317 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP12O75317 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP12O75317 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP12O75317 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP12O75317 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP12O75317 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP12O75317 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP12O75317 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP12O75317 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP12O75317 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP12O75317 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP12O75317 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP12O75317 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP12O75317 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP12O75317 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP12O75317 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP12O75317 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP12O75317 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP12O75317 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP12O75317 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP12O75317 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP12O75317 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP12O75317 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP12O75317 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP12O75317 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP12O75317 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP12O75317 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP12O75317 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP12O75317 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP12O75317 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP12O75317 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP12O75317 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP12O75317 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP12O75317 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP12O75317 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP12O75317 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP12O75317 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP12O75317 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP12O75317 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP12O75317 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP12O75317 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP12O75317 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP12O75317 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP12O75317 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP12O75317 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP12O75317 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP12O75317 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP12O75317 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP12O75317 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP12O75317 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP12O75317 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP12O75317 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP12O75317 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP12O75317 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP12O75317 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP12O75317 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP12O75317 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP12O75317 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP12O75317 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP12O75317 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP12O75317 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP12O75317 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP12O75317 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP12O75317 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP12O75317 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP12O75317 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP12O75317 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP12O75317 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP12O75317 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP12O75317 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP12O75317 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP12O75317 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP12O75317 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP12O75317 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP12O75317 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP12O75317 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP12O75317 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP12O75317 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP12O75317 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP12O75317 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP12O75317 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP12O75317 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP12O75317 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP12O75317 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP12O75317 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms