Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR3AO14802 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
POLR3AO14802 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
POLR3AO14802 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLR3AO14802 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms