Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KT08 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KT08 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KT08 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KT08 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
J3KT08 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KT08 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KT08 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KT08 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KT08 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KT08 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KT08 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KT08 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KT08 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KT08 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KT08 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KT08 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KT08 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KT08 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KT08 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KT08 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KT08 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KT08 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KT08 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KT08 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KT08 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KT08 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KT08 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KT08 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KT08 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KT08 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KT08 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KT08 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KT08 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KT08 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KT08 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KT08 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KT08 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KT08 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KT08 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KT08 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KT08 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
J3KT08 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KT08 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
J3KT08 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
J3KT08 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KT08 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms