Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRR3A8MPY1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRR3A8MPY1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 346.3 ms