Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A6NNZ2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A6NNZ2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A6NNZ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A6NNZ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A6NNZ2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A6NNZ2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
A6NNZ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A6NNZ2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A6NNZ2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A6NNZ2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A6NNZ2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A6NNZ2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A6NNZ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A6NNZ2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNZ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNZ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNZ2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNZ2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNZ2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNZ2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNZ2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNZ2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNZ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNZ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNZ2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNZ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNZ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A6NNZ2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NNZ2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NNZ2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NNZ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NNZ2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NNZ2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NNZ2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NNZ2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NNZ2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A6NNZ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NNZ2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NNZ2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NNZ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NNZ2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NNZ2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NNZ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NNZ2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NNZ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A6NNZ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A6NNZ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A6NNZ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A6NNZ2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A6NNZ2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A6NNZ2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A6NNZ2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A6NNZ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A6NNZ2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
A6NNZ2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A6NNZ2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A6NNZ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A6NNZ2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A6NNZ2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A6NNZ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A6NNZ2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A6NNZ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A6NNZ2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A6NNZ2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A6NNZ2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A6NNZ2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNZ2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNZ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNZ2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNZ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNZ2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNZ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNZ2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNZ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNZ2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNZ2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNZ2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNZ2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNZ2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A6NNZ2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A6NNZ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A6NNZ2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A6NNZ2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
A6NNZ2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A6NNZ2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A6NNZ2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A6NNZ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NNZ2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NNZ2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NNZ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NNZ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NNZ2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NNZ2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NNZ2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NNZ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NNZ2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NNZ2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NNZ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A6NNZ2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms