Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC69A6NI79 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC69A6NI79 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms