Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD5Q9P267 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms