Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLSPNQ9HAW4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms