Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFHD2Q96C19 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFHD2Q96C19 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.8 ms