Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAVIN3Q969G5 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms