Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD35Q8N283 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD35Q8N283 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms