Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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