Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZM9

PRR27, Proline-rich protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR27Q6MZM9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PRR27Q6MZM9 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms