Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RAB6CQ53S08 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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