Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms