Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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