Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 GDI2-201ENST00000380127 584 ntTSL 39.4□□□□□ -0.93e-40■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 GDI2-208ENST00000608581 634 ntTSL 39.03□□□□□ -0.963e-40■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SRCAP-205ENST00000483083 5937 ntTSL 210.11□□□□□ -0.794e-8■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 AMBRA1-211ENST00000533727 4817 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.691e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 AMBRA1-206ENST00000528950 4102 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.081e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 ABI2-206ENST00000411547 685 ntTSL 511.4□□□□□ -0.582e-10■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 ABI2-212ENST00000422719 474 ntTSL 510.75□□□□□ -0.692e-10■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 ABI2-221ENST00000451591 603 ntTSL 310.59□□□□□ -0.712e-10■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 ABI2-222ENST00000454023 940 ntTSL 310.59□□□□□ -0.712e-10■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 ABI2-216ENST00000430574 760 ntTSL 39.28□□□□□ -0.922e-10■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 ABI2-218ENST00000441061 1430 ntTSL 1 (best)9.24□□□□□ -0.932e-10■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 ABI2-209ENST00000416396 562 ntTSL 27.83□□□□□ -1.162e-10■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.693e-8■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.226e-7■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.046e-7■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.946e-8■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.476e-8■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 EIF1-202ENST00000462917 2170 ntTSL 1 (best)18.25■□□□□ 0.512e-15■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 EIF1-201ENST00000310837 1120 ntTSL 1 (best)8.35□□□□□ -1.072e-15■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.292e-15■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.412e-15■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 EIF1-205ENST00000482111 1428 ntTSL 25.86□□□□□ -1.472e-15■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.463e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 CROCCP2-201ENST00000362058 2029 ntTSL 223.99■■□□□ 1.433e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.293e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 TPCN1-222ENST00000552897 596 ntTSL 422.95■■□□□ 1.263e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 RCAN1-206ENST00000463276 686 ntTSL 322.66■■□□□ 1.223e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 CHTF18-216ENST00000565787 607 ntTSL 522.24■■□□□ 1.153e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)22.09■■□□□ 1.133e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.033e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 RB1CC1-208ENST00000521611 528 ntTSL 520.68■□□□□ 0.93e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 TPCN1-216ENST00000551096 530 ntTSL 420.21■□□□□ 0.833e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SPATS2L-221ENST00000459656 1901 ntTSL 1 (best)20.11■□□□□ 0.813e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.83e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.742e-11■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 ZZZ3-203ENST00000414381 561 ntTSL 419.6■□□□□ 0.733e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.723e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SLC12A4-208ENST00000572010 1016 ntTSL 1 (best)19.42■□□□□ 0.73e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 TPCN1-212ENST00000549279 544 ntTSL 418.99■□□□□ 0.633e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 CACNA2D4-215ENST00000542340 558 ntTSL 318.97■□□□□ 0.633e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SHROOM1-204ENST00000440118 1080 ntTSL 218.5■□□□□ 0.552e-8■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 ZZZ3-206ENST00000463166 587 ntTSL 218.45■□□□□ 0.543e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SPATS2L-225ENST00000471533 329 ntTSL 318.3■□□□□ 0.523e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 TPCN1-217ENST00000551099 570 ntTSL 418.29■□□□□ 0.523e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SRSF4-206ENST00000605204 1399 ntTSL 1 (best)18.16■□□□□ 0.52e-11■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SLC12A4-217ENST00000576462 673 ntTSL 218.11■□□□□ 0.493e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 CHTF18-218ENST00000569270 711 ntTSL 517.86■□□□□ 0.453e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 GANAB-203ENST00000524437 671 ntTSL 217.76■□□□□ 0.433e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.433e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 EPS8L2-212ENST00000528770 2233 ntTSL 217.69■□□□□ 0.422e-7■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 UBE3D-207ENST00000509102 1246 ntTSL 1 (best)17.46■□□□□ 0.393e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 STT3A-216ENST00000534472 1561 ntTSL 1 (best)17.4■□□□□ 0.383e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 GOLGA2-209ENST00000490257 1964 ntTSL 217.33■□□□□ 0.363e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SRSF4-202ENST00000466448 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.16■□□□□ 0.342e-11■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.323e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.33e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 PDIA4-202ENST00000413966 550 ntTSL 216.71■□□□□ 0.273e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SPATS2L-212ENST00000428692 541 ntTSL 416.66■□□□□ 0.263e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 GAS8-206ENST00000563980 546 ntTSL 416.59■□□□□ 0.253e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 GAS8-217ENST00000568705 659 ntTSL 316.2■□□□□ 0.183e-6■■■□□ 14.6
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PCBP2Q15366 CACNA2D4-214ENST00000541616 576 ntTSL 416.06■□□□□ 0.163e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 UBE3D-204ENST00000430071 1352 ntTSL 516.02■□□□□ 0.163e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 UBE3D-201ENST00000237186 1879 ntTSL 1 (best)16.01■□□□□ 0.153e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 PLOD1-204ENST00000449038 762 ntTSL 515.99■□□□□ 0.153e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.153e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 AFMID-213ENST00000591538 487 ntTSL 315.92■□□□□ 0.143e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.133e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 CACNA2D4-212ENST00000541331 498 ntTSL 415.78■□□□□ 0.123e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 GAS8-213ENST00000565957 549 ntTSL 415.73■□□□□ 0.113e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 PRKCZ-216ENST00000479566 501 ntTSL 315.69■□□□□ 0.13e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 MRPS5-206ENST00000475895 1672 ntTSL 215.55■□□□□ 0.083e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.063e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 CACNA2D4-217ENST00000545595 1615 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.063e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.043e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 PLOD1-203ENST00000429000 886 ntTSL 515.06■□□□□ 03e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SLC12A4-207ENST00000571299 891 ntTSL 314.86□□□□□ -0.033e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.033e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.053e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 STT3A-210ENST00000527606 569 ntTSL 414.73□□□□□ -0.053e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.083e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 CACNA2D4-205ENST00000536846 895 ntTSL 514.21□□□□□ -0.133e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SLC12A4-216ENST00000576377 868 ntTSL 514.12□□□□□ -0.153e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.173e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.23e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.23e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.212e-8■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 CACNA2D4-225ENST00000589502 680 ntTSL 313.67□□□□□ -0.223e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 PLOD1-208ENST00000485046 991 ntTSL 513.65□□□□□ -0.223e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.243e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.33e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.33e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 CACNA2D4-201ENST00000280663 5936 ntTSL 212.98□□□□□ -0.333e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.333e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 PLOD1-202ENST00000358133 819 ntTSL 312.95□□□□□ -0.343e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 MRPS5-204ENST00000464458 648 ntTSL 312.86□□□□□ -0.353e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 SPATS2L-226ENST00000471601 1730 ntTSL 212.76□□□□□ -0.373e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 MRPS5-207ENST00000482568 711 ntTSL 312.72□□□□□ -0.373e-6■■■□□ 14.6
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