Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms