Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
COPS9Q8WXC6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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