Protein–RNA interactions for Protein: Q86XS8

RNF130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF130Q86XS8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF130Q86XS8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms