Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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KRTAP27-1Q3LI81 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP27-1Q3LI81 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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