Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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NEDD8Q15843 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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NEDD8Q15843 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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NEDD8Q15843 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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NEDD8Q15843 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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NEDD8Q15843 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NEDD8Q15843 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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