Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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