Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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