Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms