Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNMA1Q12791 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms