Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP2C1P98194 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP2C1P98194 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms