Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MDH1P40925 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MDH1P40925 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
MDH1P40925 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MDH1P40925 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MDH1P40925 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDH1P40925 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms