Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TMEM225BP0DP42 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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