Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD5Q9P267 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms