Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP5Q96PP8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP5Q96PP8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms