Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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