Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms