Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPAL4Q0D2K0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms